盱眙地处北亚热带与暖温带过渡区域，属季风性湿润气候。四季分明，季际、年际变异性突出，春季气温回升快，秋季降温早，春、秋两季光照足，昼夜温差大，夏季较炎热（最高气温37～39℃，持续不超过5天），冬季寒冷早（最低气温-12℃，持续不超过7天）。2023年平均气温16.1℃，比常年（1991—2020年15.48℃）偏高0.62℃。5、12月的月平均气温较常年值偏低，12月偏低最多为0.8℃，其余各月平均气温均偏高，3月平均气温偏高最多为2.71℃。年总降水量1064.7毫米，少于常年（1991—2020年1075.9毫米）11.2毫米，年总蒸发量966.1毫米。年总日照时数2360.2小时，多于常年（1991—2020年1886.3h）473.9小时。日照，西北高于东南，年相差100～120小时；气温由西南向东北递减，相差0．4℃；降水量在水冲港、天泉湖一带最大，并形成闭合雨量圈，地域差异120毫米。